Coot et avogadro - resolution bug graphique

Du nouveau dans les dépôts (fedora update), l'arrivée de Coot-0.6.1 , une bonne nouvelle qui va considérablement améliorer l'installation de ce logiciel indispensable des cristallographes.

un simple

[root@machine ~]# yum install coot

et tout roule.....

un bémol tout de même : si vous installez sur une machine dont le système est en anglais, pas de problème, par contre si comme moi, votre fedora adorée est en français, alors une petite manip pour éviter un classique des bogues graphiques.

editez le fichier coot

[lionel@machine ~]# su -
MDP
[root@machine ~]#cd /usr/bin
[root@machine ~]# vi coot

rajoutez les lignes suivantes dans le fichier et sauvegardez.

LANG=C
LC_ALL=C
LC_NUMERIC=C
export LANG
export LC_ALL
export LC_NUMERIC

aprés plus de problème d'affichage graphique.

De même pour avogadro-1.0.0.6 qui bogue encore pas mal, et qui a le même bogue graphique que coot...

dans ce cas, /usr/bin/avogadro, n'est pas editable car c'est un fichier binaire.

créons un fichiers dans /usr/bin que nous appelerons par exemple startavogadro.sh

[lionel@machine ~]# su -
MDP
[root@machine ~]#cd /usr/bin
[root@machine ~]# vi startavogadro.sh

editez les quelques lignes suivantes.

#!/bin/sh

LANG=C
LC_ALL=C
LC_NUMERIC=C
export LANG
export LC_ALL
export LC_NUMERIC

avogadro

enregistrer le fichier ( :wq ) sous vi

maintenant pour lancer avogadro tapez startavogadro.sh ( ou le nom que vous aurez donné à ce fichier)
n'oubliez pas au préalable de le rendre exécutable, avec la commande

[root@machine ~]#chmod +x startavogadro.sh

bien sur, ces déclarations de variables peuvent se faire dans votre .cshrc, ou .bashrc ou dans votre /etc/profile, afin cela depend de vos paramêtres perso...

Comments

[modmol]

en toute honnêteté, je ne sais pas lequel est le plus ancien, dans ceux que je reference, je dirais que c'est VMD le plus ancien, sans certitude.

[Zorro]

Hello !
Tout d'abord merci pour toutes ces infos !
Une petite question, pas vraiment directement liée au sujet : quel est le plus vieux visualisateur 3D ? :)
Merci !
Z.